1.有機物去除

污水中有機物（大多數能被微生物所利用部份稱為BOD₅）的去除是靠微生物的吸附作用和微生物的代謝作用，然后對污泥與水進行分離完成的。生化反應又分為厭氧階段、兼氧階段和好氧階段。

厭氧階段（化糞池）：廢水在通過掛著產氣菌（甲烷菌）的填料層時，在產氣菌（甲烷菌）的作用下，將水中小分子的物質如有機酸和醇通過新陳代謝作用轉變?yōu)榛镜幕衔顲H₄和H₂O，從而達到去除COD的目的。

水解酸化階段：廢水通過掛上生物菌膜的填料層，大量微生物將進入水中的顆粒物質和膠體物質迅速截留和吸附，截留下來的物質吸附在水解生物菌表面，在大量水解細菌的作用下將不溶性有機物分解為可溶性物質，在產酸菌的協同作用下將大分子物質、難以降解的物質轉化為易降解的小分子物質。

好氧設計階段：本工程中好氧段采用接觸氧化法進行凈化。活性污泥中的微生物在有氧的條件下將污水中的一部分有機物用于合成新的細胞，將另一部分有機物進行分解代謝以便獲得細胞合成所需的能量，其終產物是CO₂和H₂O等穩(wěn)定物質。在這種合成代謝與分解代謝過程中，溶解性有機物(例如低分子有機酸等易降解有機物)直接進入細胞內部被利用。而非溶解性有機物則先被吸附在微生物表面，然后被酶水解后進入細胞內部被利用。微生物的好氧代謝作用對污水中的溶解性有機物和非溶解性有機物都起作用，并且代謝產物是無害的穩(wěn)定物質，因此可以進一步降低污水中的殘余有機物。

2.斜管沉淀去除好氧池污泥

污水中通過好氧池后，污泥（好氧菌種）隨池出水較多，必須通過率沉淀作用使好氧菌種沉淀下來，采用斜管沉淀工藝，是淺層沉淀理論，強化沉淀的能力，從而污水得以澄清，沉淀下來的污泥（好氧菌種）通過泵回流到厭氧池重復使用。