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Nature:十年研究解析植物關(guān)鍵酶

時(shí)間:2012-5-15閱讀:551
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來(lái)自美國(guó)薩克生物研究學(xué)院的研究員Joseph P. Noel和他的同事們?cè)谝豁?xiàng)新研究中將研究焦點(diǎn)放在了其中的一個(gè)代謝酶上,直到今天這種酶仍能有效地發(fā)揮功能被生物化學(xué)家們視為是催化上“無(wú)缺”的。在發(fā)布于5月13日《自然》(Nature)雜志上的論文中,研究人員揭示了該酶是如何從非催化性的祖先蛋白進(jìn)化而來(lái)的。

上接:Nature:追溯植物“法拉利”酶的起源
科學(xué)家們接下來(lái)在擬南芥基因組中進(jìn)一步搜索了與CHI相似的序列,從而使得他們轉(zhuǎn)向了一個(gè)稱為FAPs的蛋白家族的三個(gè)成員。FAPs在基因序列和分子骨架結(jié)構(gòu)上非常相似表明它們與CHO具有共同的根源為了了解更多信息,研究人員生成了來(lái)自FAP基因的蛋白。Noel 回憶說(shuō):“在這一過(guò)程中,我們獲得了來(lái)自植物的每個(gè)FAP基因,將它插入到大腸桿菌中,讓細(xì)菌將其轉(zhuǎn)變?yōu)槲覀兡軌蛱幚淼牡鞍踪|(zhì)。然而出人意料的是,這三個(gè)古老蛋白抓住了來(lái)自大腸桿菌宿主的一個(gè)脂肪酸分子,F(xiàn)AP蛋白緊緊地抓著它以致于我們能夠看到這一額外的分子。”
實(shí)際上,當(dāng)他們利用X射線晶體學(xué)檢測(cè)FAP蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)時(shí),他們發(fā)現(xiàn)FAP形成了口袋緊鉤到一個(gè)脂肪酸上。與之相對(duì)比,CHI包含了一個(gè)特異形狀的口袋抓住了查爾酮(chalcone)將其轉(zhuǎn)變?yōu)橹参稂S酮類化合物。

Noel研究小組追蹤三種FAPs至植物葉綠體。葉綠體是指出光合作用發(fā)生的位點(diǎn),也是脂肪酸從頭開(kāi)始合成的位點(diǎn)。葉綠體中生成的脂肪酸之后被利用在種子和胚中累積能量?jī)?chǔ)存。由于對(duì)生存至關(guān)重要,F(xiàn)APs被視為是植物主要代謝組分中重要的部分。相比之下,黃酮類化合物的合成被認(rèn)為是一種特異的代謝:黃酮類化合物促成了植物能夠在野生特定情況下長(zhǎng)期傳遞基因的能力,但當(dāng)植物被放置在調(diào)控的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中時(shí)卻并非即刻對(duì)生存起至關(guān)重要作用。
Noel說(shuō)盡管FAPs和CHI在現(xiàn)代植物中發(fā)揮著非常不同的作用,它們的遺傳和結(jié)構(gòu)相似性表明存在一個(gè)明確的進(jìn)化關(guān)系。那么哪一個(gè)是另一個(gè)的祖先?Noel認(rèn)為FAPs更年長(zhǎng)。

由于FAPs甚至在藻類(早期植物祖先的現(xiàn)代范例)中促成了初級(jí)代謝,因此相比CHI它們更有可能通過(guò)自然選擇保存了超過(guò)5億年。這一快速移動(dòng)的驅(qū)動(dòng)黃酮類化合物生成的酶有可能是在更“近”的過(guò)去形成,僅僅5億年前左右,隨著植物開(kāi)始向干涸的、紫外線明亮的陸地遷移。
Noel說(shuō)發(fā)現(xiàn)植物生物合成中兩個(gè)獨(dú)立的參與者之間的將對(duì)農(nóng)業(yè)、生物燃料和營(yíng)養(yǎng)學(xué)產(chǎn)生重大的影響。這些不同的生物化學(xué)近親的進(jìn)化重聚讓他感到非常興奮。這也是給十年研究工作打上的一個(gè)*的驚嘆號(hào),Noel的研究小組一直在鍥而不舍地追尋這一在黃酮類化合物信號(hào)通路中的關(guān)鍵酶的起源。“這真是很酷,它是的一個(gè)例子,一個(gè)不是酶的蛋白進(jìn)化成了極其有效的酶。我們可以從中得知不是我們,而是自然一直在完成一個(gè)時(shí)間為5億年的實(shí)驗(yàn)!”

來(lái)源:生物通

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