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束倫(上海)技術(shù)服務(wù)有限公司


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高通量基因測序儀

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產(chǎn)品型號RS II

品       牌

廠商性質(zhì)0

所  在  地

聯(lián)系方式:楊經(jīng)理查看聯(lián)系方式

更新時間:2022-04-01 10:51:01瀏覽次數(shù):283次

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經(jīng)營模式:

商鋪產(chǎn)品:194條

所在地區(qū):上海上海市

聯(lián)系人:楊經(jīng)理 (市場經(jīng)理)

產(chǎn)品簡介

性能指標測序讀長:平均讀長3-12Kb,最長可達30Kb

詳細介紹

性能指標

  1. 測序讀長:平均讀長 3-12 Kb,最長可達30Kb;
  2. 一致性準確率:一致性準確率可達 99.99%;
  3. GC含量檢測能力:無需PCR擴增,適合GC含量基因組;
  4. 堿基修飾:可直接讀取,并可以檢測未知堿基修飾及DNA損傷類型;
  5. 有效數(shù)據(jù)產(chǎn)量/Cell:0.5-1.2G/Cell;
  6. 輸出數(shù)據(jù)格式和數(shù)據(jù)兼容性:數(shù)據(jù)格式和二代兼容;
  7. 軟件:smrt analysis提供二級數(shù)據(jù)分析。

主要應(yīng)用

  1. 未知物種全基因組從頭測序;
  2. 已測序物種的基因組重新測序;
  3. 特定目標區(qū)域深度測序;
  4. 微生物多樣性分析(全長16S rRNA 測序);
  5. 無需拼接的轉(zhuǎn)錄組測序;
  6. 甲基化修飾等表觀遺傳學(xué)研究;
  7. 多重PCR擴增片段測序。

樣品要求

  1. 基因組或PCR產(chǎn)物:雙鏈DNA,未曾反復(fù)凍融,未曾暴露在高溫環(huán)境(>65C)和PH環(huán)境(< 6或> 9);
  2. 未經(jīng)熒光染色或紫外照射(避免EB染色);
  3. 不包含變性劑(如guanidinium salts 或 phenol)和洗滌劑(如SDS或Triton-X100);
  4. 不包含不溶解的物質(zhì);
  5. 不包含蛋白、RNA、糖類等污染;
  6. 不包含來自原始樣本的污染物(如heme, humic acid, polypheno等);
  7. OD260/OD280范圍在1.8 - 2.0,OD260/OD230 約為2.0;
  8. 基因組DNA總量>5ug,濃度>50ng/ul;PCR產(chǎn)物總量>500ng;
  9. 制備好的文庫:2100檢測圖譜和Qubit濃度定量結(jié)果;
  10. 損傷較嚴重樣品需提前說明,并與儀器操作人員聯(lián)系;
  11. 病毒、致病微生物等危險性樣本恕不接收。

儀器說明

  1. PacBio RS II測序系統(tǒng),是基于單分子實時(Single Molecule Real Time, SMRT)DNA測序技術(shù)和納米微孔應(yīng)用的第三代測序平臺。
  2. 它能帶來測序行業(yè)的一致準確性和最長的讀長,讓科學(xué)家能夠快速經(jīng)濟地完成基因組組裝,揭示并了解表觀基因組,以及鑒定基因組變異,是基因組從頭測序和全長轉(zhuǎn)錄組測序的選擇。
  3. 上海交通大學(xué)2015年引進了華東地區(qū)第二臺PacBio RS II第三代測序儀,力爭提供更全面的基因組測序服務(wù),助力基因組學(xué)研究。
  4. 該儀器由分析測試中心生命科學(xué)室管理運行。 

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