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科學(xué)家解密天然抗生素形成過程

時(shí)間:2014-10-29閱讀:393
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Nature:科學(xué)家解密天然抗生素形成過程

美國(guó)伊利諾伊大學(xué)的科研人員對(duì)天然抗生素的研究取得重大突破。他們揭示了脫水酶對(duì)縮氨酸的改變過程,從而為上千種具有醫(yī)用價(jià)值的類似分子的研究找到了新路徑。該研究zui近刊登在《自然》雜志上。

伊利諾伊大學(xué)的團(tuán)隊(duì)研究了許多具有抗生素性質(zhì)的化合物,其中zui有名的是乳酸鏈球菌。研究發(fā)現(xiàn),對(duì)乳酸鏈球菌來說,脫水酶讓該抗生素具有了zui終的三維形狀。領(lǐng)導(dǎo)這一研究的該校化學(xué)系教授威爾·弗雷德說,這是把縮氨酸轉(zhuǎn)化成五環(huán)結(jié)構(gòu)的*步。

科研人員發(fā)現(xiàn)脫水酶主要做兩件事:一是給乳酸鏈球菌肽提供谷氨酸,二是清除谷氨酸。一種酶能完成兩個(gè)*不同的活動(dòng),是因?yàn)檫@種酶與乳鏈菌肽在兩個(gè)方面起作用:脫水酶迅速抓住一部分縮氨酸,并在剩下的部分輔助建立五環(huán)結(jié)構(gòu)。

“乳鏈菌肽前體的一部分被牢牢抓住,另一部分則很靈活。靈活的部分實(shí)際上是化學(xué)反應(yīng)發(fā)生的地方。”另一名研究員、生化學(xué)教授奈爾說。

這一五環(huán)結(jié)構(gòu)對(duì)于乳酸鏈球菌的抗生素功能至關(guān)重要:其中的兩個(gè)可以攻擊細(xì)菌的細(xì)胞壁,剩下的三個(gè)會(huì)在細(xì)菌的細(xì)胞膜上打孔。該手段特別有效,會(huì)讓細(xì)菌對(duì)抗生素更加難以抵抗。

乳酸鏈球菌是牛奶里的天然成分,也可在實(shí)驗(yàn)室合成,在食品添加劑中用作防腐劑。上世紀(jì)60年代,乳酸鏈球菌開始被用來消滅食源性的病原體。

研究人員早已知道乳酸鏈球菌的基因序列,并能以此合成縮氨酸,但縮氨酸會(huì)在細(xì)胞內(nèi)發(fā)生變化,從而形成zui終的結(jié)構(gòu)和功能。研究發(fā)現(xiàn),脫水酶參與了縮氨酸的改變,但是科學(xué)家之前不知道具體過程,這也阻礙了許多類似化合物的研究。威爾弗雷德說,這些化合物本可以在抗擊食源性疾病或危險(xiǎn)的微生物傳染病方面發(fā)揮重要作用。

威爾弗雷德實(shí)驗(yàn)室的一名研究生奧爾特加還發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)運(yùn)RNA會(huì)提供谷氨酸,可以有助于脫水酶對(duì)乳酸鏈球菌進(jìn)行定型。

“這項(xiàng)研究中,我們回答了人們存在的疑惑,即化學(xué)層面的脫水是怎么發(fā)生的。”威爾弗雷德說,“這的確照亮了一片新天地?,F(xiàn)在,我們和其他實(shí)驗(yàn)室可以做許多之前難以進(jìn)行的研究了。”

原文檢索:

Manuel A. Ortega, Yue Hao, Qi Zhang, Mark C. Walker, Wilfred A. van der Donk & Satish K. Nair. Structure and mechanism of the tRNA-dependent lantibiotic dehydratase NisB. Nature, 26 October 2014; doi:10.1038/nature13888

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