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轉錄組水平分析子宮內膜容受性

時間:2015-11-24閱讀:432
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子宮內膜容受性是哺乳動物胚胎成功著床*的。然而,遺傳信息的缺乏仍然是理解奶山羊從接受前期子宮內膜(PE)發(fā)育成接受期子宮內膜(RE)過程中潛在機制的一個障礙。

在這項研究中,西北農林科技大學動物科技學院曹斌云教授課題組采用轉錄組測序獲取超過4千萬高質量的讀段,通過de novo組裝獲得了102,441unigenes。使用已知數據庫對這些unigenes進行注釋??偣灿?/span>3,255unigenesPERE中差異表達(DEGs)(P值<0.05)。此外,還鑒定出76,729~77,102個假定的SNPs12,837SSRs。進一步生物信息學分析DEGs,揭示許多生物學過程和通路可能涉及RE建立,特別是包括GO項:蛋白水解,細胞凋亡,細胞黏附,以及KEGG通路:細胞周期和細胞外基質(ECM-受體相互作用。研究人員推測,ADCY8VCANSPOCK1,THBS1,和THBS2可能在子宮內膜容受性發(fā)育中發(fā)揮重要作用。

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