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證實(shí)CRISPR–Cas13可靶向哺乳動物細(xì)胞中的RNA

時間:2017-10-9閱讀:303
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早在2016年,科學(xué)家們就發(fā)現(xiàn)了結(jié)合和切割單鏈RNA而不是DNA的CRISPR蛋白(Science, doi:10.1126/science.aaf5573)。如今,在一項(xiàng)新的研究中,來自美國麻省理工學(xué)院(MIT)的研究人員對這種被稱作CRISPR-Cas13a的系統(tǒng)進(jìn)行調(diào)整,使之在哺乳動物細(xì)胞中發(fā)揮作用。相關(guān)研究結(jié)果于2017年10月4日在線發(fā)表在Nature期刊上,論文標(biāo)題為“RNA targeting with CRISPR–Cas13”。

 

 在美國羅徹斯特大學(xué)開展RNA靶向CRISPR系統(tǒng)研究的Mitchell O’Connell(未參與這項(xiàng)研究)注意到,“在CRISPR之前,RNAi(RNA干擾)是調(diào)節(jié)基因表達(dá)的理想方法。但是Cas13a的重大益處之一是它似乎具有更強(qiáng)的特異性,而且這種系統(tǒng)對哺乳動物細(xì)胞而言并不是內(nèi)源性的,因此你不太可能擾亂細(xì)胞中天然的轉(zhuǎn)錄后網(wǎng)絡(luò)。相反,RNAi利用內(nèi)源性機(jī)制開展基因敲降(gene knockdown,即抑制基因表達(dá))。”

 

在這項(xiàng)新的研究中,來自MIT的張峰(Feng Zhang,音譯)教授和他的同事們證實(shí)切割RNA的Cas13a酶(之前稱作C2c2)能夠特異性地降低哺乳動物細(xì)胞中的內(nèi)源性RNA和報(bào)告RNA水平。 這些研究人員已從多種細(xì)菌物種中尋找一種能夠切割大腸桿菌報(bào)告基因的Cas13a酶。張峰教授和他的同事們著重關(guān)注來自細(xì)菌Leptotrichia wadei的Cas13a酶,這是因?yàn)榻?jīng)證實(shí)它zui為地切割它的RNA靶標(biāo)。

 

 他們隨后構(gòu)造出一種雙質(zhì)粒RNA靶向CRISPR系統(tǒng),該系統(tǒng)在不同的質(zhì)粒上表達(dá)向?qū)NA(gRNA)和Cas13a基因,其中Cas13a基因含有一種經(jīng)過改造的核定位序列(nuclear localization sequence)。在人細(xì)胞系中,這種CRISPR-Cas13a構(gòu)造物地切割報(bào)告質(zhì)粒(reporter plasmid)中轉(zhuǎn)錄的RNA和三種內(nèi)源性基因轉(zhuǎn)錄的RNA。

 

 這種RNA靶向系統(tǒng)能夠類似地抑制體外培養(yǎng)的源自水稻(Oryza sativa)的原生質(zhì)體(移除細(xì)胞壁的細(xì)胞)中的內(nèi)源性基因。

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