深圳子科生物報(bào)道:12月23日,清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院王新泉教授與醫(yī)學(xué)院向燁研究員合作在《細(xì)胞研究》(Cell Research)期刊在線發(fā)表題為《SARS冠狀病毒刺突糖蛋白冷凍電鏡結(jié)構(gòu)揭示其受體結(jié)合的必需構(gòu)象狀態(tài)》(Cryo-electron microscopy structures of the SARS-CoV spike glycoprotein reveal a prerequisite conformational state for receptor binding)的研究論文,解析了高致病性冠狀病毒SARS-CoV表面刺突蛋白(spike)蛋白的近原子分辨率結(jié)構(gòu),并捕捉到刺突蛋白的多種中間構(gòu)象,揭示了SARS冠狀病毒入侵宿主細(xì)胞過程中必需的動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)變化。
高致病性冠狀病毒感染是公共衛(wèi)生的重大威脅。2002-2003年嚴(yán)重急性呼吸道綜合征冠狀病毒(SARS-CoV)的爆發(fā)導(dǎo)致8000多人感染,800多人死亡;2012年中東呼吸系統(tǒng)綜合征冠狀病毒(MERS-CoV)從中東地區(qū)開始流行,已導(dǎo)致1800多人感染,600多人死亡。2015年世界衛(wèi)生組織列出了8種可能引起嚴(yán)重爆發(fā)性流行的危險(xiǎn)病原體,SARS冠狀病毒和中東呼吸系統(tǒng)綜合征冠狀病毒名列其中。迄今為止,還沒有針對(duì)這兩種冠狀病毒的特異性藥物和疫苗。
冠狀病毒刺突蛋白(spike)為同源三聚體,位于病毒囊膜表面,是已知zui大的病毒表面蛋白。刺突蛋白在病毒與宿主細(xì)胞接觸,與宿主細(xì)胞受體結(jié)合以及病毒-宿主細(xì)胞膜融合過程中起著關(guān)鍵作用,同時(shí)也是中和抗體結(jié)合及疫苗研發(fā)的重要靶點(diǎn)。

冠狀病毒刺突蛋白從非激活態(tài)到激活態(tài)的構(gòu)象變化
本研究通過冷凍電鏡單顆粒三維重構(gòu)的方法解析了SARS冠狀病毒刺突蛋白四種構(gòu)象的結(jié)構(gòu)。其中構(gòu)象一為三重對(duì)稱的結(jié)構(gòu),分辨率達(dá)4.3 埃,在此構(gòu)象下刺突蛋白的三個(gè)受體結(jié)合區(qū)(RBD)都處于“向下”位置,由于空間位阻,SARS冠狀病毒細(xì)胞受體血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2(ACE2)無法結(jié)合刺突蛋白,因此該構(gòu)象為受體結(jié)合的非激活狀態(tài)。其余三種構(gòu)象刺突蛋白的對(duì)稱性被破壞,一個(gè)受體結(jié)合區(qū)抬起處于“向上”位置,在該構(gòu)象下細(xì)胞受體能順利結(jié)合抬起的受體結(jié)合區(qū)而沒有空間位阻,因此這三種構(gòu)象為受體結(jié)合的激活狀態(tài)。受體結(jié)合區(qū)從“向下”位置到“向上”位置的轉(zhuǎn)換也是中和性抗體與spike的結(jié)合所必需,并且可推廣到中東呼吸系統(tǒng)綜合征冠狀病毒等其他類似的冠狀病毒,這對(duì)理解冠狀病毒侵染宿主細(xì)胞的分子機(jī)制,以及特異性藥物和疫苗的開發(fā)提供了重要指導(dǎo)。
王新泉教授和向燁研究員均為北京結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心及清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院傳染病研究中心成員,長(zhǎng)期從事病毒侵染及免疫逃逸相關(guān)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究。2013、2014和2015年,王新泉教授和張林琦教授團(tuán)隊(duì)在《細(xì)胞研究》(Cell Research)、《科學(xué)-轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》(Science Translational Medicine)和《科學(xué)報(bào)告》(Scientific Reports)上分別報(bào)道了中東呼吸系統(tǒng)綜合征冠狀病毒表面刺突蛋白的受體結(jié)合區(qū)受體結(jié)合區(qū)與人受體二肽基肽酶4(DPP4)復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu),靶向受體結(jié)合區(qū)的中東呼吸系統(tǒng)綜合征冠狀病毒人源中和性抗體MERS-4和MERS-27的篩選與鑒定,以及MERS-27發(fā)揮中和作用的分子機(jī)制。2016年2月,向燁研究員團(tuán)隊(duì)與合作者在《科學(xué)》(Science)期刊上報(bào)道了埃博拉病毒表面糖蛋白GP與中和抗體的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)和中和機(jī)制;6月,向燁研究員團(tuán)隊(duì)又獨(dú)立在《自然》(Nature)期刊上報(bào)道了噬菌體突破細(xì)菌細(xì)胞膜的新機(jī)制。此次,兩研究組共同協(xié)作,解析了SARS冠狀病毒刺突蛋白的冷凍電鏡結(jié)構(gòu),并捕捉到了病毒侵染過程中關(guān)鍵的中間狀態(tài),極大地促進(jìn)了研究界對(duì)病毒侵染機(jī)制的理解。
清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院向燁研究組聯(lián)合培養(yǎng)博士生桂淼和生命學(xué)院2014級(jí)博士生宋文飛為本論文的共同*作者,王新泉教授和向燁研究員為本論文的共同通訊作者。
王新泉教授實(shí)驗(yàn)室博士生周海霞,向燁研究員實(shí)驗(yàn)室博士生許靖蔚和陳思煉參與了本項(xiàng)工作。該工作的冷凍電鏡數(shù)據(jù)采集在國家蛋白質(zhì)科學(xué)設(shè)施(北京)的清華大學(xué)冷凍電鏡平臺(tái)完成,數(shù)據(jù)處理在國家蛋白質(zhì)科學(xué)設(shè)施(北京)清華大學(xué)高性能計(jì)算平臺(tái)完成。本工作獲得國家自然科學(xué)基金委、科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和北京市結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心等的經(jīng)費(fèi)支持。