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西安交大一附院李磊教授用單細胞外顯子組測序研究腎細胞癌

時間:2016-12-22閱讀:1344
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深圳子科生物報道:腎細胞癌(RCC)占成人惡性腫瘤的3%,和腎腫瘤的90%~95%。轉移性疾病通常會對放療和化療產生耐藥性。免疫治療表現出15%至20%的有限反應率。腫瘤干細胞(CSCs)是腎癌發(fā)生、發(fā)展以及耐藥性的關鍵參與因子。以前的研究已經表明,RCC是一種遺傳學明顯不同的成人癌癥,具有相對較低的突變率。測序分析表明,一些常見的體細胞突變在RCC患者之間是共有的。zui近,單細胞外顯子組測序已被用于評估許多類型腫瘤中的體細胞突變。然而,尚未系統(tǒng)地將該技術用于識別RCC的CSCs中的關鍵基因。

zui近,來自西安交通大學*附屬醫(yī)院、中科院生物物理研究所、北京Jianlan醫(yī)學研究所、深圳羅湖醫(yī)院、中科院微生物研究所和諾禾致源生物信息科技有限公司的研究人員,利用單細胞外顯子組測序,將KCP、LOC440040和LOC440563突變確定為腎細胞癌干細胞中的驅動因子。相關研究結果發(fā)表在12月16日的《Cell Research》雜志。這篇論文的通訊作者是西安交通大學*附屬醫(yī)院泌尿外科教授李磊博士。

在這項研究中,研究人員利用單細胞外顯子組測序,發(fā)現CD133+ RCC細胞有CSC特性,并可能來源于癌細胞,而不是正常腎細胞。KCP、LOC440040和LOC440563突變是新的腎腫瘤干細胞驅動基因。LOC440563編碼一個RNA結合蛋白,其屬于不均一核糖核蛋白(hnRNPs)。它影響前mRNA的加工、代謝和運輸。LOC440563在結腸癌中是顯著突變的;然而,這些基因突變不同于我們在RCC腫瘤干細胞中所確定的??紤]到hnRNP家族對DNA損傷修復的貢獻,很可能LOC440563突變通過損害DNA修復過程而驅動CSC的多能性。

LOC440040是一個GRM5(谷氨酸受體、代謝型5)假基因。GRM5屬于mGluR家族,失調的谷氨酸信號參與了許多類型的癌癥,如神經膠質瘤、黑色素瘤。然而,LOC440040和癌癥之間的關系目前還不清楚。確定突變體LOC440040是否影響RCC CSC群的谷氨酸能信號,將是十分必要的。

KCP編碼一個分泌蛋白,它在TGF-β途徑的調控作用中發(fā)揮復雜的作用。異常的KCP水平可能導致無數的腎臟病理與癌癥。這項工作中所確定的KCP突變是否通過影響TGF-β信號而促進腫瘤干細胞的自我更新?十分有必要弄清這些問題。zui后,這項研究表明,KCP、LOC440040、LOC440563突變——目前存在于至少20%的參與調查的患者中,構成了強大而危險的驅動因子,促進腎細胞癌癌細胞重編程為CSCs。因此,它們可以作為RCC重要的預后因素和治療靶點。

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