RNA世界假說,英文為RNA World hypothesis,是科學(xué)依據(jù)多年的科學(xué)研究而提出的一條關(guān)于生命科學(xué)的理論。其內(nèi)容為:生命進(jìn)化的早期,沒有蛋白質(zhì)(酶),某些RNA可以催化RNA的復(fù)制——也就是說RNA是*的遺傳物質(zhì),是生命的源頭。
RNA自我復(fù)制的RNA世界假說的一個重要組成部分,但是,在實(shí)驗(yàn)室里生成能夠合成、復(fù)制、擴(kuò)增具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)的功能性RNA分子的核酶,已被證明是很困難的。直到現(xiàn)在,I類RNA聚合酶核酶zui成功的變種,即使對它們偏愛的模板——具有高濃度嘧啶的短的、簡單的RNA序列——也能起有效作用。
8月15日在PNAS發(fā)表的一篇論文中,來自斯克里普斯研究所的科學(xué)家,利用體外進(jìn)化,制備了一種改進(jìn)的聚合酶核酶,能合成多種功能性的、結(jié)構(gòu)化的RNA,并擴(kuò)增短的RNA模板。
伊利諾伊大學(xué)香檳分校的Scott Silverman沒有參與這項(xiàng)研究,但是他說:“這項(xiàng)研究擴(kuò)展了RNA進(jìn)行RNA聚合的能力,這在以前是沒有實(shí)現(xiàn)過的。這是理解‘RNA聚合酶能做些什么’領(lǐng)域的一個關(guān)鍵進(jìn)步,對于RNA世界理論有相當(dāng)重要的影響。”
研究的合作者、斯克里普斯研究所的Gerald Joyce和David Horning開始于I類RNA聚合酶核酶的一個變體。他們在其整個序列中引入隨機(jī)突變,以產(chǎn)生100兆個變種。然后,Joyce和Horning通過促使核酶完成RNA適配體——與一種合成維生素B12或GTP結(jié)合的分子,向這個群體施加壓力。每一輪,研究人員都會選擇的核酶,能夠生產(chǎn)功能性的產(chǎn)品、正確長度的產(chǎn)品、或兩者兼有。
研究人員通過要求核酶在較短時間內(nèi)合成更長的RNA分子,增加了連續(xù)世代的選擇嚴(yán)格性。在第二十四輪,該群體可以合成富含嘌呤的、功能性的RNA序列。
從這個群體中,Horning和Joyce分離出了核酶的一個變型,稱為24-3,它有17個突變。24-3聚合酶使用所有四個堿基,能比起始聚合酶更快的發(fā)揮作用。它能夠復(fù)制多種具有復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)的功能性RNA,包括適體、其他核酶和酵母轉(zhuǎn)移RNA(tRNA)。研究人員發(fā)現(xiàn),在只有RNA的PCR版本中,24-3也能以指數(shù)方式擴(kuò)增短的RNA模板。
英國MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的Philipp Holliger,沒有參加這項(xiàng)工作,在給The Scientist寫的一封電子郵件中他寫道:“這真的是一項(xiàng)的工作,也是向‘實(shí)現(xiàn)RNA自我復(fù)制’邁出的重要一步。”
密蘇里大學(xué)的Donald Burke-Agüero也沒有參與這項(xiàng)研究,他說:“Horning和Joyce的這項(xiàng)工作,是邁出的精彩一步。它使我們更接近于有一個RNA復(fù)制系統(tǒng),可以維持RNA的復(fù)制。”
然而,24-3聚合酶核酶不能復(fù)制自身。雖然與早期聚合酶核酶合成的產(chǎn)物相比,酵母tRNA是高度結(jié)構(gòu)化的和比較大的,但是24-3核酶比酵母tRNA大三倍,并包含更復(fù)雜的結(jié)構(gòu)要素。
Joyce、Horning和他的同事們正在進(jìn)行體外進(jìn)化實(shí)驗(yàn),來克服這一局限性。研究人員說,嚴(yán)格的選擇標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)促使核酶更有效地生產(chǎn)更大的、更復(fù)雜的功能性產(chǎn)品,然而目前還不清楚要多少試管世代,才能實(shí)現(xiàn)這一切。
同時,Joyce指出了“研究一種自我復(fù)制核酶”在進(jìn)化生物學(xué)研究中的應(yīng)用。Joyce說:“如果你有一種RNA酶是RNA復(fù)制酶,可以以指數(shù)方式復(fù)制RNA,包括自身的副本,然后我會說它是活的。那么,它是由進(jìn)化決定的。”