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福建農(nóng)林大學(xué)張亮生課題組Nature發(fā)表睡蓮基因組

時(shí)間:2019/12/20閱讀:545
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深圳子科生物報(bào)道:福建農(nóng)林大學(xué)張亮生課題組及其合作者本周在《Nature》雜志上發(fā)表了題為“The water lily genome and the early evolution of flowering plants”的論文,報(bào)告了藍(lán)星睡蓮(Nymphaea colorata)的基因組,并通過(guò)其基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果展示了早期被子植物的進(jìn)化特征。


(圖片來(lái)源:田納西大學(xué))

睡蓮一直是藝術(shù)家眼中的寵兒,在繪畫和雕塑等藝術(shù)領(lǐng)域?qū)乙姴货r。在古埃及,睡蓮與中國(guó)的荷花一樣,被視為圣潔、美麗的化身。法國(guó)印象派大師莫奈曾以睡蓮為主題創(chuàng)造了一組畫。

在這項(xiàng)研究中,作者利用PacBio RSII SMRT測(cè)序技術(shù)獲得了藍(lán)星睡蓮的高質(zhì)量基因組(409 M)。系統(tǒng)發(fā)育分析的結(jié)果表明,睡蓮和無(wú)油樟(Amborellales)是早期的兩個(gè)開花植物譜系,這可能是由于大約一億多年前(1.47-1.85億年)的全基因組復(fù)制事件。

開花植物,也稱為被子植物,是陸地上種類zui多的一類植物。目前有64個(gè)目,416個(gè)科,大約13,000個(gè)屬和300,000個(gè)已知物種。睡蓮科植物是古老的雙子葉植物,也有某些單子葉植物的特征。因此研究它在被子植物中的進(jìn)化具有十分重要的意義。

研究人員還發(fā)現(xiàn),藍(lán)星睡蓮的ABCE基因在各個(gè)花器官中廣泛表達(dá),這表明了花發(fā)育的古老ABCE模型。早期被子植物的ABCE基因可能廣泛表達(dá),隨著核心雙子葉植物的進(jìn)化,基因表達(dá)和功能可能由更專門的ABCE基因來(lái)調(diào)控。這也解釋了睡蓮的萼片和花瓣沒(méi)有真正意義上的分化,與原始被子植物的花相似。

美國(guó)田納西大學(xué)植物科學(xué)系的陳峰教授及其團(tuán)隊(duì)也參與了此項(xiàng)研究,他也是南京農(nóng)業(yè)大學(xué)的客座教授。這個(gè)團(tuán)隊(duì)致力于分析睡蓮中花香生物合成的遺傳基礎(chǔ)。“吸引傳粉媒介的花香對(duì)植物的多樣性以及農(nóng)業(yè)生產(chǎn)都是至關(guān)重要的,”他說(shuō)。

根據(jù)美國(guó)農(nóng)業(yè)部的統(tǒng)計(jì),世界上75%的開花植物和35%的糧食作物都依靠昆蟲等動(dòng)物來(lái)傳粉和繁殖。許多傳粉的動(dòng)物都依靠花香來(lái)定位植物的花朵。“無(wú)油樟的花是沒(méi)有香味的,因此,了解開花植物如何進(jìn)化出香味很有意思,”陳教授說(shuō)。他在2013年參與發(fā)表了無(wú)油樟的基因組。

“睡蓮已經(jīng)進(jìn)化出誘人的花香和顏色,這是核心被子植物共有的特征,”陳教授指出。“我們分析的化學(xué)成分和生物合成基因表明,睡蓮的香味與核心被子植物平行進(jìn)化。由于其*的系統(tǒng)發(fā)育位置,花香生物合成及其他性狀揭示了所有被子植物的早期進(jìn)化特征。”(生物通 薄荷)

原文檢索

Zhang, L., Chen, F., Zhang, X. et al. The water lily genome and the early evolution of flowering plants. Nature (2019) doi:10.1038/s41586-019-1852-5

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