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上海永葉生物科技有限公司

Nature聚焦下一代癌癥指標(biāo)(上)

時間:2014-8-1閱讀:239
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如果能夠得到充分利用,血液循環(huán)中的腫瘤DNA將為癌癥治療帶來一場變革。
2012年,英國癌癥研究所的Charles Swanton在對腎臟腫瘤進(jìn)行DNA測序時發(fā)現(xiàn),單個腫瘤中存在著驚人的遺傳學(xué)多樣性,只有三分之一的突變是整體共有的。此外,癌轉(zhuǎn)移形成的二級腫瘤也與原發(fā)瘤大相徑庭。
這些結(jié)果說明,標(biāo)準(zhǔn)程序(tissue biopsy)根本不足以判斷癌癥的預(yù)后情況。而且活檢得到的是靜態(tài)信息,無法準(zhǔn)確反映癌癥的演化。在這種情況下,ctDNA就成為了科學(xué)家們的新希望,它能為人們揭示更多的癌癥信息,甚至跟蹤癌癥的發(fā)展。
ctDNA是什么
癌細(xì)胞在破裂和死亡時,會釋放出循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)等內(nèi)容物,這種ctDNA是飄浮在血液中的基因組片段。細(xì)胞殘骸一般由清道夫細(xì)胞(如巨噬細(xì)胞)清除,然而腫瘤很大細(xì)胞增殖又很快,導(dǎo)致清道夫細(xì)胞應(yīng)付不過來。
對血液中的腫瘤DNA進(jìn)行檢測和測序,可以幫助人們通過取血得到更全面的癌癥信息,告訴醫(yī)生治療是否已經(jīng)起作用,腫瘤有沒有演化出抗性。
當(dāng)然這一技術(shù)的應(yīng)用也面臨著一些問題。舉例來說,不同人的ctDNA水平差異較大,而且ctDNA并不那么容易檢測,特別是在腫瘤的早期階段。另外,人們還需要在更大型的研究中進(jìn)行驗(yàn)證,看ctDNA是否給出了足夠準(zhǔn)確的信息。
如果能夠克服上述障礙,醫(yī)生們將能根據(jù)ctDNA進(jìn)行更好的治療,隨著癌癥的演化調(diào)整治療策略,Johns Hopkins大學(xué)的Victor Velculescu說。“這種技術(shù)可以幫助人們zui終實(shí)現(xiàn)個性化醫(yī)療,為癌癥領(lǐng)域帶來一場新的變革。”(延伸閱讀:腫瘤異質(zhì)性VS靶向性治療)
ctDNA發(fā)展簡史
1948年科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)人體血液中存在著循環(huán)DNA,癌癥患者的循環(huán)DNA則發(fā)現(xiàn)于1977年。在那之后又過了17年,人們才發(fā)現(xiàn)這些DNA含有癌癥的標(biāo)志性突變,說明它們來自于腫瘤。
zui開始,循環(huán)DNA的實(shí)際應(yīng)用并不在癌癥領(lǐng)域。鑒于腫瘤DNA會流入血液,香港中文大學(xué)的盧煜明(Dennis Lo)教授推測胎兒DNA應(yīng)該也能進(jìn)入血液。1997年他向人們成功展示,孕婦血液中攜帶著男性胎兒的Y染色體。這一發(fā)現(xiàn)允許醫(yī)生們在懷孕初期通過*方式檢測胎兒的性別,甚至篩查唐氏綜合癥等發(fā)育疾病。這是產(chǎn)前診斷領(lǐng)域的一次革命。
“癌癥研究后來才跟上進(jìn)度,”英國癌癥研究所Nitzan Rosenfeld說。這是因?yàn)槟[瘤DNA比胎兒DNA更難檢測,而且早期的測序技術(shù)還不夠準(zhǔn)確可靠。
近十年來隨著技術(shù)的進(jìn)步,DNA檢測技術(shù)已經(jīng)足夠靈敏。舉例來說,BEAMing擴(kuò)增法可將循環(huán)DNA連在磁珠上,然后進(jìn)行分離和計(jì)數(shù)。即使健康細(xì)胞DNA與ctDNA的比值達(dá)到10,000:1,BEAMing擴(kuò)增法也可以有效檢測出ctDNA來。

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