生物通報道  十多年前，研究人員發(fā)現(xiàn)了細胞沉默基因的一種古老的機制。就如同用調(diào)光開關(guān)關(guān)燈一樣，RNA干擾（RNAi）在簡單生物體以及人類中下調(diào)基因活性?？茖W家們抓住RNAi作為一種工具來“關(guān)小”基因確定它們的功能，這一研究領(lǐng)域稱之為功能基因組學。
為了充分利用RNAi技術(shù)進行疾病研究，博德研究所的科學家們開發(fā)出RNAi平臺旨在努力構(gòu)建一個能夠靶向人類和小鼠基因組中的每個基因的RNAi試劑庫。他們的努力終于換來了能與科學界公開分享的一個大型的、良好的RNAi試劑集。這一平臺還增加了稱為開放閱讀框（ORFs）的互補試劑資源來“打開”基因。

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盡管該平臺的試劑庫成為了探究基因功能的強大工具，科學家們還希望能利用它們來解決面對的成本、通道和通量等限制。除了所需的專門設(shè)備，現(xiàn)有的篩查方法需要耗費大量的細胞、試劑和病毒。幾年前，博德研究所一個研究小組的研究人員提出如果能夠縮小整個過程使得大規(guī)模篩查更快更廉價，那么將使得更多地方的更多科學家們能夠利用這一巨大的資源。
現(xiàn)在他們的努力換來了一種稱為MicroSCALE（空間局限粘性慢病毒特征芯片）新型的、便攜式的“細胞芯片”，這種芯片克服了現(xiàn)有功能基因組學方法的局限。這一篩選設(shè)備代表了該平臺探究基因功能的工具箱中另一個創(chuàng)新工具。領(lǐng)導這一研究的是博德研究所資深準會員、懷特黑德生物醫(yī)學研究所成員David Sabatini。此外，研究人員還證實了這一芯片的性能，利用它揭示了黑色素瘤耐藥的潛在基因及信號通路。這一研究的部分資金由博德研究所科學規(guī)劃和資源分配委員會（SPARC）資助，相關(guān)論文發(fā)布在5月15日的《科學信號》（Science Signaling）雜志上。

新研究的首作者、Sabatini 實驗室博士后學者Kris Wood, 說：“博德研究所的RNAi 和ORF庫代表了一項巨大的投資，堪稱是世界上從事功能基因組學研究的工具。然而，一旦獲得開發(fā)，實際上利用這些工具來探討某些生物學問題還可能存在困難，這是由于與篩選方式有關(guān)的邏輯和經(jīng)濟現(xiàn)實所致。”
研究人員的目的是開發(fā)一種能夠克服當前篩選方法難題的新系統(tǒng)。一種稱為基于多孔板的篩選方法（multi-well plate-based screening）是開展功能性篩查的歷史性金標準。這種篩查方法是通用的，但是它需要大量的細胞、顯著的試劑成本，以及當前尚未廣泛使用的*設(shè)備。一種稱為混合篩選（pooled screening）的新方法可在一個細胞培養(yǎng)皿中同時對數(shù)千種不同的病毒進行檢測。這種方法相對于多孔板篩選更有效和廉價。但是它限制了細胞測量的種類，且需要相當數(shù)量的細胞和勞力。

為了克服這些方法的局限，獲得它們的特性即多空板篩查的分析通用性和混合篩查的有效性，研究小組著手構(gòu)建一種使該過程小型化的系統(tǒng)。研究人員設(shè)計了一個系統(tǒng)，在其載玻片上印有一千到五千個微型特異細胞粘附凝膠點。他們接下來設(shè)計了一種集中RNAi和ORF傳遞病毒的方法以確保每次添加一個*的病毒到每個點上。
 

來源：生物通