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中科院杰青研究組文章解析DNA分析新方法

閱讀:629發(fā)布時(shí)間:2011-3-14

來(lái)自中科院動(dòng)物研究所,武漢大學(xué)的研究人員建立了一個(gè)測(cè)定Kf的等溫差異雜交方法,為了解生理?xiàng)l件下G-四重折疊形成提供一個(gè)有用的工具。這一研究成果公布在Anal. Chem.雜志上。
  領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是動(dòng)物研究所譚錚研究員,這位研究人員回國(guó)后曾在華南理工大學(xué),武漢大學(xué)等多處任職,2005年加入中科院動(dòng)物研究所,曾獲得國(guó)家杰出青年科學(xué)基金,入選*"百人計(jì)劃"國(guó)外引進(jìn)杰出人才,其課題組主要研究方向是衰老的分子生物學(xué)研究。
  人端粒DNA和其他很多富*(G)序列能形成一類(lèi)稱(chēng)作*-四重折疊(G-quadruplex)的DNA四重折疊結(jié)構(gòu)。這種結(jié)構(gòu)與很多生物學(xué)過(guò)程、治療癌癥以及分子機(jī)器有關(guān)。折疊平衡常數(shù)Kf是衡量G-四重折疊形成能力的定量描述。生理?xiàng)l件下的G-四重折疊結(jié)構(gòu)不是獨(dú)立存在,而是伴有旁側(cè)結(jié)構(gòu)或與蛋白結(jié)合。然而現(xiàn)有的Kf測(cè)定方法只能用于核心序列。
  在這篇文章中,譚錚研究組建立了一個(gè)測(cè)定Kf的等溫差異雜交方法,不僅能用于核心序列,同時(shí)適用于伴有旁側(cè)結(jié)構(gòu)或結(jié)合蛋白存在的情況這一方法將為了解生理?xiàng)l件下G-四重折疊形成提供一個(gè)有用的工具。
  近期有關(guān)DNA研究也獲得了許多重要成果,讓人印象深刻的就是來(lái)自愛(ài)荷華大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)當(dāng)一種特殊的DNA重復(fù)片段——Alu元件插入到基因中,可以改變蛋白質(zhì)生成的速率,從而導(dǎo)致了不同物種中不同生物學(xué)特性的進(jìn)化。
  Alu元件大約是在6000萬(wàn)年前隨靈長(zhǎng)動(dòng)物的進(jìn)化而出現(xiàn)的一種特殊的DNA重復(fù)序列。其他的哺乳動(dòng)物基因組中不存在有Alu元件。在人類(lèi)基因組中Alu元件是zui常見(jiàn)的一種可移動(dòng)DNA,并能夠跳躍至基因組序列的其他位置。當(dāng)他們插入到包含基因區(qū)域時(shí),這些元件有可能轉(zhuǎn)變?yōu)樾峦怙@子。盡管在十幾年前科學(xué)家們就明確Alu元件是人類(lèi)基因組中新外顯子的重要來(lái)源,但是一直也無(wú)法確定這些新外顯子是否真正具有重要的生物功能。
  這篇文章利用高通量RNA測(cè)序新技術(shù)分析了來(lái)自人類(lèi)小腦的1.2億個(gè)RNA序列,進(jìn)而對(duì)Alu衍生的外顯子插入成熟RNA序列中的頻率進(jìn)行了定量,并由此確定了它們?cè)诨蛑械牟迦胛恢靡约皕ui終蛋白質(zhì)生成的藍(lán)圖。
 


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