酶標(biāo)記抗體法和熒光素標(biāo)記抗體法的原理類似，分為直接法和間接法，其原理基本相同，但敏感性不同。
（一）直接法
直接法是將酶（如HRP）標(biāo)記在特異性抗體（*抗體）上，然后用酶標(biāo)記抗體直接與相應(yīng)原特異性結(jié)合，形成抗原—抗體—HRP復(fù)合物，zui后用酶底物DAB-H202顯色。該法的優(yōu)點是簡單、步驟少，省時、特異性高、非特異性染色輕：缺點是敏感性差，因為一個抗原決定簇只結(jié)合一個HRP分子（假設(shè)一個抗體分子與一個HRP分子結(jié)合）。另外，一種標(biāo)記抗體也只能檢測一種抗原。若要檢測多種抗原，就必須標(biāo)記每一種特異抗體，這樣既麻煩又不經(jīng)濟。目前此法很少應(yīng)用，但在單克隆抗體制備過程中，為了更特異地篩選單抗，仍常用此法。
（二）間接法
間接法也稱夾心法，是直接法的簡單改進，將酶示蹤物標(biāo)記在二抗上，再與*抗體（已與相應(yīng)抗原反應(yīng)形成復(fù)合物的IgG）反應(yīng)，然后進行顯色反應(yīng)。此法要求第二抗體與特異性抗體（一抗）應(yīng)是不同種屬的動物產(chǎn)生，如特異性抗體（一抗）是兔抗人IgG，酶標(biāo)記抗體（二抗）則可以是羊抗兔抗體。該法與直接法比較有以下優(yōu)點：
①應(yīng)用面較寬，僅標(biāo)記一種二抗就可以檢測眾多相同的*抗體，例如眾多一抗為兔來源，只要標(biāo)記一種抗兔二抗就可用于所有抗兔一抗的檢測，不需要對每種特異性抗體進行標(biāo)記；
②敏感性增加，*抗體的工作濃度在直接法的基礎(chǔ)上進一步稀釋；
③可以商品化購置；
④可以設(shè)計各種對照。
