生物安全柜在安裝時以及以后每隔一定時間，要由有資質的專業(yè)人員按照規(guī)定對每一臺生物安全柜的整體運行性能進行性能檢測，以檢查其是否符合國家及的性能標準。生物安全柜檢測主要包括物理學檢測和生物學檢測兩個方面，根據檢測性質可分為檢測、后續(xù)檢測，參照JG 170—2005，推薦檢測項目見表。
生物安全柜檢測除以上項目，必要時還需檢測換氣次數和紫外線強度。
換氣次數主要檢測當生物安全柜向室內排氣時對生物實驗室空氣的擾動影響，一萬級生物實驗室要求15～25次/h，十萬級生物實驗室要求l0～15次/h，為保證生物實驗室壓力穩(wěn)定，建議換氣次數為35次／h。
紫外線強度主要檢測紫外燈的殺菌效果，按照《消毒技術規(guī)范》規(guī)定的要求，高強度紫外線新燈的輻照強度應大于180uW／cm3（253.7nm，距離1m處），新普通紫外線燈管輻射強度大于90uW／cm為合格。正在使用中的燈管輻射強度zui低應達到70uW／cm暫可使用，但必須延長照射時間。若紫外線光源的強度低于40uW／cm：，則再延長照射時間也不能起到滿意的殺菌作用，即應停止使用。不要認為紫外線燈管只要亮著就還有殺菌作用。
除生物安全柜的一年一度的常規(guī)檢測外，下列情況之一時，如安裝后、移動后、檢修后、更換過濾器后，也必須進行現場生物安全柜檢測。