氣相色譜儀作為一項成熟的分析技術(shù)儀器可連接多種檢測器，在代謝組學中以火焰離子化檢測器(FID)和質(zhì)譜檢測器zui為常見。
質(zhì)譜檢測器可以通過標準譜圖庫提供化合物結(jié)構(gòu)信息，并具有高靈敏度等優(yōu)勢，因而非常適合于代謝組學的研究。對極性強、揮發(fā)性低、熱穩(wěn)定性差的物質(zhì)需要衍生化后再進行GC—Ms分析舊。衍生化不僅可以改善分析對象的揮發(fā)性、峰形、分離度，也可提高檢測的靈敏度。
Winder等"叫用氣相色譜-飛行時間質(zhì)譜(GC—TOF Ms)技術(shù)對大腸桿菌提取物進行了全組分分析，建立了細胞淬滅和胞內(nèi)物質(zhì)提取的評價方法，證明統(tǒng)計分析方法和實驗結(jié)合才能實現(xiàn)胞內(nèi)物質(zhì)的定量。Ding等舊1J利用GC．TOF Ms測定工業(yè)酒精連續(xù)發(fā)酵和一次性發(fā)酵過程中酵母細胞內(nèi)代謝物質(zhì)的差異，分別檢測到143和128種化合物。在轉(zhuǎn)基因水稻研究中，引用GC．FID分析野生型和轉(zhuǎn)基因型水稻代謝表型的差異，用Gc-MS鑒定了在轉(zhuǎn)基因和環(huán)境影響下水稻中含量均有顯著性差異的代謝物，對轉(zhuǎn)基因水稻的安全性進行了初步的研究。
在對復雜樣品進行分析時，由于峰容量的限制，一維色譜很難達到理想的分離效果，多維色譜是改進分辨率的辦法之一。全二維氣相色譜(GC×Gc)把分離機理不同而又相互獨立的兩根色譜柱以串聯(lián)方式連接在一起，這兩根色譜柱之間裝有一個調(diào)制器(調(diào)制器起捕集再傳送的作用)，經(jīng)*柱分離的組分由調(diào)制器聚焦后以脈沖方式進入第二柱進行進一步的分離，所有組分從第二根色譜柱進入檢測器。GC×GC有別于中心切割的二維氣相色譜(GC+Gc)。GC+Gc是把*根色譜柱流出的部分餾分轉(zhuǎn)移到第二根色譜柱上進行進一步分離，峰容量是兩根柱的峰容量之和；而GC×GC是兩根柱的峰容量之積，因而大大提高了分離系統(tǒng)的分辨率。由于GC xGc在第二維上的分離非常快，一般使用FID做檢測器，與質(zhì)譜聯(lián)用時僅TOF Ms能夠?qū)崿F(xiàn)快速掃描。
GC×GC越來越多地應用于石油化工、環(huán)境保護、藥物開發(fā)、植物研究等復雜樣品的分離分析。通過實驗證明，在代謝組學研究中應用GC×GC—MS可以減少基質(zhì)干擾、增大峰容量，與采用一維GC—MS相比，GC x GC-MS更適合于生物樣品的定量分析?？梢灶A期，GC×GC技術(shù)將會在復雜混合物的分離分析尤其是代謝組學的研究中發(fā)揮更大的作用。
