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RNA測(cè)序技術(shù)

2010-10-14  閱讀(4040)

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摘要: 來(lái)自美國(guó)特拉華大學(xué)的科學(xué)家們?cè)谛》肿覴NAs研究方面做出了重大貢獻(xiàn):他們發(fā)現(xiàn)擬南芥中的RNAs實(shí)際數(shù)目比以前所知的多10倍以上。

來(lái)自美國(guó)特拉華大學(xué)的科學(xué)家們?cè)谛》肿覴NAs研究方面做出了重大貢獻(xiàn):他們發(fā)現(xiàn)擬南芥中的RNAs實(shí)際數(shù)目比以前所知的多10倍以上。

小分子RNAs是近十年來(lái)生命科學(xué)界zui重要的發(fā)現(xiàn)之一,這些核糖核酸雖然小,但是卻在動(dòng)植物基因調(diào)控中扮演著重要的角色。植物體內(nèi)如果缺乏小分子RNAs就會(huì)對(duì)植物生長(zhǎng)有復(fù)雜長(zhǎng)久的影響,而且小分子RNAs也參與了其它一些重要的生理過(guò)程,比如抗逆性。

為了能夠了解生物機(jī)體中小分子RNAs的整體作用與個(gè)體生物角色,確定體內(nèi)RNAs的序列是十分之必要的。雖然之前也有不同動(dòng)植物的幾千個(gè)小分子RNAs被測(cè)序確定,但是這些傳統(tǒng)方法不能夠在基因組的水平上進(jìn)行完整的測(cè)序,得到的結(jié)果缺乏豐度和整體規(guī)則感。

特拉華的研究人員利用一種稱(chēng)之為“大規(guī)模平行信號(hào)測(cè)序系統(tǒng)”(Massively Parallel Signature Sequencing,MPSS)轉(zhuǎn)錄組分析技術(shù)的方法來(lái)進(jìn)行擬南芥的測(cè)序。這一由英國(guó)劍橋大學(xué)獨(dú)立出來(lái)的Solexa公司開(kāi)發(fā)的技術(shù)(現(xiàn)Takara也在其DNA Micro-beads Array技術(shù)中運(yùn)用)是一種利用EST序列數(shù)據(jù)庫(kù)分析基因轉(zhuǎn)錄信息的分析方法,改善了之前令科學(xué)家頭痛的耗時(shí)耗力的實(shí)驗(yàn)過(guò)程。

利用這一技術(shù),研究人員完成了擬南芥種子和花朵22,000,000個(gè)小分子RNAs的測(cè)序,并發(fā)現(xiàn)了75,000個(gè)未發(fā)現(xiàn)的小分子RNA序列。而在這之前,擬南芥中總共也才測(cè)序了6,000個(gè)小分子RNAs。而且利用MPSS得到的結(jié)果數(shù)量多,質(zhì)量也較好,在這項(xiàng)研究中,研究者們發(fā)現(xiàn)了許多高調(diào)控的小分子RNAs。

除了獲得了序列信息,特拉華大學(xué)研究人員也發(fā)現(xiàn)了一個(gè)令他們驚訝的結(jié)果:之前推測(cè)認(rèn)為非轉(zhuǎn)錄活性區(qū)域被證明是龐大數(shù)量小分子RNAs的活性區(qū)域。這些發(fā)現(xiàn)對(duì)于未來(lái)RNA和轉(zhuǎn)錄調(diào)控的研究有非常重要的意義,并且也預(yù)示著這一領(lǐng)域的研究在將來(lái)一定會(huì)蓬勃發(fā)展。

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