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據(jù)一期《分子系統(tǒng)生物學(xué)》報(bào)道,加拿大研究人員開(kāi)發(fā)出一種新技術(shù),可將DNA(脫氧核糖核酸)條形碼拼接在單個(gè)細(xì)胞內(nèi),以同時(shí)搜索數(shù)以百萬(wàn)計(jì)蛋白質(zhì)對(duì)之間的相互作用。
近年來(lái),DNA條形碼技術(shù)使科學(xué)家開(kāi)展高并行試驗(yàn)(許多不同類型的細(xì)胞在同一試管內(nèi)進(jìn)行試驗(yàn))成為可能,而新一代DNA測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,進(jìn)一步提高了對(duì)條形碼計(jì)數(shù)和讀取結(jié)果的效率。
然而,可在同一試管內(nèi)進(jìn)行的試驗(yàn)次數(shù),卻受限于編碼的細(xì)胞類型數(shù)量。一直以來(lái),DNA條形碼都是一維的,也就是一個(gè)條形碼只能做一次試驗(yàn)。允許條形碼在細(xì)胞內(nèi)融合在一起,意味著科學(xué)家們現(xiàn)在可以打破這一障礙。新技術(shù)可顯著提高在單一試管內(nèi)進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)次數(shù),在同等成本條件下能將效率提高10倍。
在廣泛使用的酵母雙雜交(Y2H)方法中,攜帶一個(gè)“誘餌”蛋白的酵母細(xì)胞與攜帶一個(gè)“獵物”蛋白的酵母細(xì)胞配對(duì)。對(duì)Y2H系統(tǒng)進(jìn)行操縱后,只有“誘餌”與“獵物”蛋白黏在一起的細(xì)胞才能存活,從而使科學(xué)家可以觀察到哪些蛋白間互相關(guān)聯(lián)。在被命名為“條形碼融合遺傳學(xué)—酵母雙雜交(BFG-Y2H)”的新技術(shù)中,攜帶著數(shù)千“誘餌”和“獵物”蛋白的細(xì)胞在同一培養(yǎng)皿中配對(duì)。
BFG-Y2H方法的新穎之處在于,通過(guò)對(duì)細(xì)胞編程,將來(lái)自“誘餌”和“獵物”細(xì)胞的DNA條形碼連接在一起,形成一個(gè)“融合條形碼”,然后利用新一代DNA測(cè)序方法對(duì)融合條形碼進(jìn)行檢測(cè)。
研究人員稱,這項(xiàng)研究的zui終目標(biāo),是建立蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)的三維視圖,而不是靜態(tài)圖。通過(guò)有效建立含有更豐富信息的蛋白相互作用圖譜,BFG-Y2H方法可拓展研究人員對(duì)細(xì)胞工作機(jī)理的理解,并展現(xiàn)只在某種特定環(huán)境條件下才能發(fā)生的蛋白相互作用,從而加速對(duì)基因功能和人類疾病的理解。
有一種條碼,并不是印在物品上,而是存在于動(dòng)植物DNA中,這就是“生命的條形碼”。DNA條形碼為現(xiàn)代生物學(xué)提供了豐富的分子信息,對(duì)鑒定物種及物種間親緣關(guān)系等研究意義重大。不過(guò),此前的實(shí)驗(yàn)效率仍然受細(xì)胞類型的限制,現(xiàn)在新融合技術(shù)的出現(xiàn),讓研究人員在一個(gè)試管內(nèi),可以并行檢測(cè)到數(shù)百萬(wàn)個(gè)蛋白質(zhì)配對(duì)。
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