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微生物組樣本和人類來源聯(lián)系起來-齊一生物

時(shí)間:2015-5-12閱讀:182
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科研人員報(bào)告了用于識(shí)別人類微生物組樣本的*而穩(wěn)定的元基因組編碼。血型和基因組變異一直被用于在法醫(yī)鑒定、家譜和災(zāi)難響應(yīng)中鑒別個(gè)體,但是微生物組——見于每個(gè)人的微生物的構(gòu)成的補(bǔ)體——迄今為止沒能提供*的識(shí)別特征,出現(xiàn)這種情況的原因部分是由于缺乏人群中的個(gè)體微生物組的可靠、穩(wěn)定而*的編碼。Curtis Huttenhower 及其同事開發(fā)了一種算法,從而根據(jù)身體不同部位的微生物物種和基因,建立元基因組編碼,并把這種算法應(yīng)用到了來自人類微生物組工程招募的120人的樣本上。人類微生物組工程是一個(gè)研究人類微生物組的政府資助的協(xié)作體。這組作者僅僅根據(jù)身體部位特異性微生物組編碼,就從許多人中間準(zhǔn)確分辨出了個(gè)體的微生物組。當(dāng)對每個(gè)受試者訪問的30到300天后收集的樣本重復(fù)這一分析的時(shí)候,使用同樣的編碼可以一對一地識(shí)別出大約30%的樣本,幾乎沒有假陽性;在至多一年之后,使用大便樣本的重復(fù)分析正確識(shí)別出了大約80%的微生物組,這提示了來自腸道微生物組的編碼具有相對的穩(wěn)定性。這組作者說,由于微生物組庫的相當(dāng)一部分樣本可能有潛力在數(shù)據(jù)庫中被一對一地識(shí)別出來,其中某些樣本可能含有敏感的個(gè)人信息,因此不能假定這類樣本具有*的匿名性。
原文檢索:Identifying personal microbiomes using metagenomic codes

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