研究所的研究人員在會上表示，在利用新一代測序的基因檢測集合來篩查患者時，他們發(fā)現(xiàn)了一些意義不明的變異。
研究人員篩查了12名婦女，她們?nèi)狈?/span>BRCA1或BRCA2突變，但有著其他的乳腺癌相關(guān)突變。研究人員發(fā)現(xiàn)，其中8名婦女帶有意義不明的變異。之后，她們再次研究了這些變異的意義，發(fā)現(xiàn)一些能夠被歸為良性，而另一些是可能有害的。
乳腺癌是*婦女的*殺手，大約有5-10%的癌癥是遺傳的。盡管BRCA1和BRCA2突變占了遺傳性乳腺癌病例的近半數(shù)，但是其他基因的變異也與疾病風(fēng)險相關(guān)，這就給診斷帶來了挑戰(zhàn)。
除了開發(fā)BRCA1和BRCA2的基因檢測，研究人員還開發(fā)了一種名為Breast Cancer Panel 2（BCP2）的檢測，針對15個基因中的變異，包括ATM、CHEK2、PTEN、RAD50和TP53。
研究人員利用BCP2對12名缺乏BRCA1或BRCA2突變的婦女進(jìn)行篩查。她們從每名患者的外周血樣本中提取DNA，并在Thermo Fisher Ion PGM測序儀上進(jìn)行測序，之后通過Sanger測序來驗證。根據(jù)獲得的報告，她們在文獻(xiàn)中搜索那些結(jié)果可能意味著什么。
研究人員表示，報告可能是三種結(jié)果中的一種：陽性結(jié)果，發(fā)現(xiàn)已知的致病變異；發(fā)現(xiàn)VUS；陰性結(jié)果，未發(fā)現(xiàn)任何已知的致病變異或VUS。不過，她指出，陰性結(jié)果也不一定是結(jié)論性的，因為婦女可能在她們未檢測的基因中帶有突變。
在這項研究中，研究人員無法在4名患者的樣本中上找到臨床突變，而在另外8名患者中，她們發(fā)現(xiàn)了一個或多個基因帶有臨床意義不明的變異。其中，4名患者是ATM基因有VUS，而3名患者是PALB2基因有VUS。Torrezan表示，許多VUS是新生錯義突變或次要等位基因頻率低的錯義突變。
不過，研究人員補充道，一些VUS的狀態(tài)已經(jīng)改變。在她準(zhǔn)備演講稿時，再次進(jìn)行數(shù)據(jù)庫的搜索，發(fā)現(xiàn)PALB2和CHEK2中的VUS已經(jīng)被分別歸類為良性和危害性。她認(rèn)為，這也強調(diào)了計算機分析工具的重要性，必須保持?jǐn)?shù)據(jù)庫更新，并開展不同變異的功能研究，才能了解它們的意義。
