單細(xì)胞基因表達(dá)的大規(guī)模分析，有可能發(fā)現(xiàn)罕見的細(xì)胞群和血統(tǒng)關(guān)系，但是需要有效的方法進(jìn)行細(xì)胞捕獲和mRNA測序。盡管細(xì)胞條形碼策略允許超低深度的單細(xì)胞平行測序，但是測序深度較淺的限制還沒有得到直接的研究。
研究小組使用的技術(shù)，主要集中在一個“微流體”設(shè)備，在這個設(shè)備中單個細(xì)胞被捕獲并流入納米級的小室中，那里它們有效而地進(jìn)行DNA測序所必需的化學(xué)反應(yīng)。研究表明，確定和拼出*序列，并成功地確定細(xì)胞類型所需要的閱讀步驟數(shù)量，比原先估計的少100倍。這項技術(shù)，是由Fluidigm公司開發(fā)，可同時用于96個細(xì)胞的單獨(dú)過程。
Kriegstein稱，識別不同細(xì)胞類型的數(shù)百個新型生物標(biāo)志物，將提高科學(xué)家們對于出現(xiàn)特化神經(jīng)元亞型的理解。zui終，這種集中于單細(xì)胞基因活性的新方法，與其他單細(xì)胞技術(shù)（包括顯微成像）相結(jié)合，可能會揭示腦部發(fā)育障礙的起源。
Kriegstein指出，這個過程可以揭示一些腦部疾病，包括平腦癥，這種疾病患者大腦皮層中的褶皺無法發(fā)育，而且疾病在發(fā)育后期才被診斷，如自閉癥和精神分裂癥。
根據(jù)這篇論文的作者介紹，這種分析單細(xì)胞中分子的策略，不僅有利于研究特化細(xì)胞如何出現(xiàn)在發(fā)育有機(jī)體的特定時間和地點(diǎn)，也有利于監(jiān)測干細(xì)胞（設(shè)計用于組織置換）的細(xì)胞特性，以及調(diào)查腫瘤內(nèi)細(xì)胞多樣性以確定癌細(xì)胞存活和傳播的原因。
任何未經(jīng)處理的生物樣品，無論多么純，其中都含有各種各樣代表不同組織類型的細(xì)胞。研究人員已經(jīng)測定了這些樣品中的結(jié)合遺傳物質(zhì)。為了研究哪些基因是活躍的，哪些是休眠的，他們使用測序步驟的無理性重復(fù)，來捕捉足夠數(shù)量的信使RNA序列，這些序列轉(zhuǎn)錄自交換基因。然而，很難從混合組織樣品中推斷，哪些基因是由特定的細(xì)胞類型表達(dá)的。
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