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裂殖酵母采用多種末端連接法修復(fù)DNA損傷

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裂殖酵母采用多種末端連接法修復(fù)DNA損傷
報(bào)道了一個(gè)在裂殖酵母中檢測(cè)染色體上進(jìn)行的末端連接修復(fù)的方法,并利用此方法分析了機(jī)理不同的三類(lèi)末端連接修復(fù)方式。

非同源末端連接(NHEJ)是哺乳動(dòng)物中修復(fù)DNA雙鏈斷裂的主要方式。參與NHEJ的修復(fù)蛋白如Ku,ligase IV,XLF,和X家族DNA聚合酶在裂殖酵母中都是保守的。通過(guò)表達(dá)一個(gè)高特異性的核酸內(nèi)切酶來(lái)產(chǎn)生基因組上一個(gè)特定位置的雙鏈斷裂,作者建立了結(jié)合傳統(tǒng)測(cè)序和高通量測(cè)序全面分析不修復(fù)產(chǎn)物序列的方法,對(duì)突變體中修復(fù)產(chǎn)物序列的分析驗(yàn)證了Ku,ligase IV和XLF在經(jīng)典N(xiāo)HEJ中的核心作用,以及X家族DNA聚合酶Pol4在間隙*(Gap Filling)中的重要作用。研究發(fā)現(xiàn)在Ku或ligase IV缺失的突變體中,兩種非NHEJ的另類(lèi)末端連接仍能發(fā)生。其中一種方式利用了DNA斷裂位置兩側(cè)的微同源(microhomology)序列并造成幾百至幾千堿基的缺失,另外一種方式則只在酶切位點(diǎn)處引入堿基置換。

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